Cell | 染色质激活或抑制状态决定了核小体除去的差异性

核糖构件通过有助于或诱导该构件的转录可以控制真核生物的特性和肝细胞身分视作。这些核糖构件中所存在特定的组抗原中所文后润色（posttranslational modifications，PTMs），它们与特定转录静止状态方面，并可有助于诱导性染色体构件的形成，影响等位基因的表达。为了在肝生殖细胞时依然保持特相合性程序的完整性，决定核糖构件的分子特征也必须在子代肝细胞中所成立。成立不尽完全一致类改型核糖静止状态的不可或缺直接影响是组抗原PTMs，主要存在于组抗原H3和H4的尾巴上。因此，在肝生殖细胞的过程中所，除了DNA遗传物质，子代核小体也必须重建，并资源分配到子代肝细胞中所。无论如何，研究成果见到子代的经典组抗原（比如遗传物质依赖的组抗原）会在遗传物质叉后迅速新的组装。不尽完全一致的研究成果组见到H3K9me3和H3K27me2/3可通过有丝分裂性状。然而，这两个组抗原润色都是与诱导性核糖构件方面。那么，子代中所的核小体，以及它们携带的组抗原PTMs是否都能性状到子代肝细胞完全一致的等位基因坐位上呢？来自纽约大学兰戈恩医学中所心的Danny Reinberg教授课题组在Cell撰写研究成果Active and Repressed Chromatin Domains Exhibit Distinct Nucleosome Segregation during DNA Replication，该研究成果见到在DNA遗传物质时，作用于与颇受诱导核糖周边地区的核小体分离出来是不尽完全一致的。颇受诱导核糖构件中所的核小体会被迁移在子代肝细胞完全一致的等位基因周边地区，而作用于改型核糖构件中所的核小体的资源分配则是弥散和随机的。为研究成果核小体的分离出来持续性，研究成果者在候选等位基因坐位不可逆的上标组抗原H3.1和H3.2，以肠道体细胞干肝细胞中所核小体在肝生殖细胞时的推移。最简单来说，该方法通过周边抗原上标技术，来进行CRISPR为特定等位基因坐位的H3.1和H3.2带上丝氨酸上标，经ChIP-qPCR探测该丝氨酸上标在肝细胞周期G1期和S期的轻元素，以自由基核小体的分离出来持续性。若该残基H3.1和H3.2上的丝氨酸上标在一次肝生殖细胞后下降一半，说明了该核小体被迁移在了两个子代肝细胞的完全一致等位基因坐位上；若该丝氨酸润色很快消失，说明了子代肝细胞仍未性状该等位基因坐位的核小体。研究成果者首先探测了在体细胞干肝细胞中所沉默表达的Hoxc6， Ebf1， Meis2等位基因的核小体分离出来持续性。这些等位基因坐位的核小体丝氨酸技术水平随肝生殖细胞慢慢减半，这提示颇受诱导的等位基因坐位的核小体会被迁移在子代肝细胞的完全一致位置。这与其成见到的H3K9me3和H3K27me2/3可通过有丝分裂性状的反常相印证。那么，作用于改型核糖周边地区的核小体又是如何分离出来的呢？研究成果者探测了在体细胞干肝细胞中所被作用于表达的Ccna2， Nanog和Pou5f1等位基因，见到该等位基因坐位的丝氨酸上标在肝生殖细胞后排列成弥散静止状态，轻元素很低，这提示对于作用于改型核糖周边地区来说，子代核小体未精确的资源分配到子代肝细胞其所的等位基因坐位，而是随机资源分配的。更古怪的是，在诱导体细胞干肝细胞分化时，Hoxc6等位基因由诱导转回作用于，它的核小体资源分配模式也由精确的同残基资源分配改为随机资源分配。这说明了子代核小体的局部资源分配，可以体现该核糖周边地区的活性静止状态。总的来说，该研究成果通过CRISPR正向的组抗原丝氨酸上标系统，研究成果了核小体在肝生殖细胞过程中所的等价，并见到作用于与颇受诱导的核糖周边地区的核小体等价的不尽完全一致。值得注意的是，在肝细胞周期的S期中所，颇受诱导的核糖周边地区的遗传物质要晚于作用于改型核糖周边地区。这个小时差相合也避免常核糖的遗传物质频率大于相合核糖。相合核糖相对更快的遗传物质飞行速度可能必要了核小体的精确资源分配，而常核糖中所的PTMs则由其所的主调节遗传物质（master regulators）单独标识其所DNA碱基，并召募PTMs蛋白酶新的成立。原始出处：Escobar TM1, Oksuz O1, Salda?a-Meyer R1, et al.Active and Repressed Chromatin Domains Exhibit Distinct Nucleosome Segregation during DNA Replication.Cell. 2019 Oct 31;179(4):953-963.e11. doi: 10.1016/j.cell.2019.10.009.