Mol Cell:张锋再造三合一组合抑制剂的新型CRISPR Cas13系统

近日，康乃尔大学和纽约大学Broad研究者所听见好消息：Pardis C. Sabeti、张锋等科学家联合开发设计者借助于一种新型的抗大肠杆菌系统设计。世界性上有许多常见的致命病原体都是基于核酸RNA的大肠杆菌，像是埃博拉大肠杆菌、坪村卡大肠杆菌和流感大肠杆菌。该系统设计在CRISPR Cas13应用的基础上再度升级，可用于材料和破坏全人类细胞内中所具有核酸RNA的大肠杆菌。该研究者登载在《Molecular Cell》杂志上。CRISPR系统设计为抗大肠杆菌方法造成曙光在此之前，张锋设计者团队的研究者应用人员凭借着CRISPR/Cas9系统设计为加固免疫系统设计抵抗大肠杆菌进犯造成新希望。然而，进犯全人类的大肠杆菌极为多变，即使是在同一物种内，也能迅速直接影响环境。因此我们需要极其灵活的预防大肠杆菌平台。为了探求新抗大肠杆菌方针，研究者应用人员将眼中重归了CRISPR Cas13系统设计，Cas13激酶可以天然地药物酵母菌中所的大肠杆菌RNA。它可以对蛋白质进行编程，从大肠杆菌固体中所掺入特定的真核细胞基因序列。尽管CRISPR Cas13系统设计仍然存在一些显然，但是该方法在研究小组中所并能操作，并且在此之前张锋设计者团队的研究者应用人员在哺乳动物细胞内中所已经进行了必要的实验证明。研究者应用人员开发设计者了一种取名为CARVER的新型平台，它能将Cas13介导的大肠杆菌RNA裂解与基于Cas13的迅速诊断读数结合借助于去，用于特定的高灵敏度激酶研究报告底物通关（SHERLOCK）平台，材料消灭基于RNA的大肠杆菌。创始人；还有的系统设计研究者应用人员首先筛选了350多个全人类之外大肠杆菌（HAV）遗传物质，以鉴定Cas13可以有效药物的大肠杆菌RNA基因序列。他们主要四处寻找的是既难于突变，又最有确实在切割后禁用大肠杆菌的片段。大肠杆菌遗传物质中所潜在的Cas13目标底物纽约大学Cameron Sabeti研究小组的研究工作MyhrvoldClark暗示：“实际上，你可以编程Cas13来偷袭大肠杆菌的任何部分。但是物种内部和物种间都有巨大的多元性，随着大肠杆菌的演化出，极少遗传物质都遭遇了短时间内的变化。如果你不故意，你确实会追求最终未缺点的目标。”然后，他们通过测算分析测序数据库，以具体数百种大肠杆菌物种中所的数千个潜在底物，这些底物确实是Cas13的有效靶标。年中，研究者应用人员设计者了该系统设计的Cas13督导RNA。新编程的Cas13在受到感染了抗原内性脉络膜脑膜炎大肠杆菌（LCMV）、甲型流感大肠杆菌（IAV）和水泡性口炎大肠杆菌（VSV）的全人类细胞内中所进行了实验测试。将Cas13引入材料后24时长，研究者应用人员检视到培养物中所大肠杆菌RNA的水平下降了40倍。随后，研究者应用人员检查了Cas1抑止大肠杆菌细菌受到感染的能力。研究者数据库显示：大肠杆菌暴露后八时长，Cas13将流感大肠杆菌的受到感染力下降了300倍以上。最后，该设计者团队用于SHERLOCK材料应用来实时探测Cas13药物后的大肠杆菌RNA水平。该材料系统设计提供了有关治果的迅速反馈以及有关特定大肠杆菌突变的信息。前言对于大肠杆菌受到感染的化疗，虽然已经首肯了90多种抗病物，但它们只能化疗9种疾病。总体而言，只有16种大肠杆菌具有FDA首肯的药物。因此，见到行之有效的抗大肠杆菌方法显得尤为重要。该研究者的第一所写 Catherine Freije 暗示：“Cas13可以是一种研究者来进行，来探求全人类细胞内中所大肠杆菌生物学的许多方面，它也确实是一种诊疗来进行，用于诊断抽取，化疗大肠杆菌受到感染，并衡量化疗的精确性——所有这些都能让CARVER在新或耐药性大肠杆菌借助于现时短时间内直接影响和促使。”许多现代借助于处:PFreije CA1, Myhrvold C2, Boehm CK3, et a1.Programmable Inhibition and Detection of RNA Viruses Using Cas13.Mol Cell. 2019 Oct 2. pii: S1097-2765(19)30698-7. doi: 10.1016/j.molcel.2019.09.013. [Epub ahead of print]