Cell Res：北京基因组所合作揭示 RNA 甲基化基因表达 R -loop 形成及转录终止

R-loop 是一种由 RNA：DNA 杂合链和单链 DNA 分成的特别遗传物质骨架，在线粒体和真核海洋生物的序列之前分布普遍且与此相关。R-loop 在很多极为重要的分子海洋生物学过程之前发挥重要机能，包括体细胞会结构上、特异性催化反应、DNA 伤害修整以及序列反应性等，但其如何被精确催化反应的功能尚不似乎。m6A 结构上作为哨兵 RNA 上丰度最高的结构上类型，普遍积极参与哺乳动物的发育、自体、胚胎备份、碳水化合物其发展、以及分解成和分散等人类过程。然而，在此之前尚不似乎 m6A 是否能作为 R -loop 之前 RNA 成分的因由特征来催化反应 R -loop 高水平，进而发挥各种分子海洋生物学机能。之前科院北京序列分析所杨运桂、任捷与上海交通大学生科院孙前文制作组合作分析，找到 m6A 能安定 R-loop 的演化成，进而催化反应DNA特异性的有效率停止。这一成果以《m6A promotes R-loop formation to facilitate transcription termination》为题于 10 月 12 日在线发表于《细胞会分析》（Cell Research）杂志。分析制作组首先通过斑点分子杂交和自体荧光高效率，找到敲低 m6A 甲基分散酶 METTL3 显着减少 R -loop 高水平，且该催化反应极为重要依赖于 METTL3 甲基分散酶活性。随后，制作组核心人物并用高效基质基质协同质谱高效率，找到比起于染色体相结合的 RNA（caRNA），R-loop 的 RNA 成分有更加富含的 m6A 结构上。实质性并用基于单链 DNA 建库的 DNA：RNA 杂合链自体共沉淀数据处理人类DNA组计划高效率（ssDRIP-seq），找到下调的 R -loop 主要富含在特异性停止区域，R-loop 变化程度与 m6A 的距离和结构上高水平相关。为了探索 m6A 对 R -loop 催化反应的分子海洋生物学机能，分析制作组绘制了 RNA 聚合酶特异性位点的数字化图集，并在 MYC、ACTIN DNA上同步进行多种特异性活性探测，找到 m6A 推动 R -loop 演化成是特异性停止阶段的极为重要步骤，可以防止 RNA 聚合酶的特异性通读。先前，制作组核心人物借助于了针对特异性通读的报告DNA系统，通过 m6A 结构上位点的DNA实质性证实 m6A 对于 R -loop 演化成及特异性停止的极为重要极为重要。该分析找到了 m6A DNA结构上的共特异性催化反应机能，推断出了 RNA DNA结构上对体细胞会骨架的影响，以及 R-loop 骨架之前的 RNA 成分被结构上后对其自身稳态的催化反应功能，阐释了 m6A 通过安定 R-loop 而推动特异性正常人停止的反常，为实质性分析 m6A 与 R-loop 的催化反应功能和相应分子海洋生物学机能提供了理论上的高效率和理论依靠。该分析得到了之前国科学院战略性先导新技术专项、国家自然科学以及国家全面性研发计划等基金赞助。原始出处：Xin Yang， Qian-Lan Liu， Wei Xu， et al. m6A promotes R-loop formation to facilitate transcription termination. Cell Research (2019).